Real Madrid chắc chắn sợ nhất Lionel Messi bên phía Barca. Trong những lần hai đội chạm trán tại Bernabeu, Leo chọc thủng lưới đội chủ nhà 14 lần.
Hàng phòng ngự Real Madrid sẽ phải luôn đề phòng và dành sự chăm sóc đặc biệt đối với Lionel Messi ở El Clasico diễn ra ngày 23/12 tới. Trong 24 bàn của Leo, “Los Blancos” để tiền đạo số một Barca thực hiện tới 14 lần trên sân nhà Bernabeu, nhiều hơn 4 khi hai đội gặp nhau tại Nou Camp của đội bóng xứ Catalan.
Ngày 2/5/2009 rất đáng nhớ đối với Lionel Messi, nhưng lại trở thành ác mộng cho hàng phòng ngự Real Madrid ngay tại Bernabeu. Anh lập cú đúp, giúp Barca thắng 6-2 ngay trong năm đầu tiên dưới sự dẫn dắt của huấn luyện viên Pep Guardiola.
Mùa giải tiếp theo, Leo tiếp tục ghi bàn ở Bernabeu. Đón đường chuyền từ Xavi, anh vượt qua Raul Albiol, sau đó đánh bại Iker Casillas để giúp Barca vượt qua Real Madrid 2-0.
Mùa giải 2010/11, chỉ vài ngày sau khi chọc thủng lưới Real Madrid từ chấm 11 m tại La Liga, Messi lập cú đúp khi tái đấu “Los Blancos” ở Champions League.
Ngôi sao số một Barca tiếp tục sút lưới đội bóng Hoàng gia ở mùa giải 2011/12 sau khi vượt qua Pepe và Casillas. Tuy nhiên, Leo phải mất 1 năm mới có thêm bàn vào lưới Real bằng cú đá phạt khi hai đội gặp nhau tại siêu cúp Tây Ban Nha, nhưng không đủ giúp Barca giành danh hiệu.
Bàn thắng tiếp theo của Leo trong trận làm khách trước Real tại La Liga diễn ra vào mùa giải 2012/13. Lần này, anh đánh bại thủ môn Diego Lopez bên phía đại kình địch.
Mùa bóng sau đó, Messi có hat-trick thứ hai vào lưới “Los Blancos”, nhưng lần đầu làm được điều này ở Bernabeu. Anh góp phần giúp Barca đánh bại Real 4-3, trong đó có 2 bàn thắng được thực hiện từ chấm 11 m.
Tuy nhiên, Messi phải mất thêm 3 năm mới lại tỏa sáng tại Bernabeu. Ở siêu kinh điển mùa trước, anh lập cú đúp để giúp Barca thắng kịch tính 3-2. Trong đó, Leo ghi bàn phút bù giờ thứ hai và ăn mừng đặc biệt bằng cách cởi áo khoe trước hàng chục nghìn khán giả ngay trên sân của đội bóng Hoàng gia Tây Ban Nha.